伯豪生物单细胞核产品加服务: 带你乘风精准研核,发文章冲击国自然!
伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。
技术流程
单细胞核 RNA 测序(snRNA-seq)的优势
1)冷冻组织可以用于直接抽提细胞核,为临床回顾性研究中单细胞测序的开展提供了解决方案。
2)有些组织通过酶解消化很难拿到高质量的细胞悬液,通过抽提细胞核,避开酶解消化,是一个更好的选择。
3)适用于对解离酶敏感(如神经元、肝实质细胞)、直径较大、形状不规则(如心肌细胞)等特殊细胞类型。
4)直接从组织抽提细胞核,不需要酶解消化及恒温孵育,避免了组织解离过程中诱导应激基因的表达。
伯豪生物单细胞核 RNA 测序优势
1、高质量抽核:抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;
2、标准化内控:丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;
3、流程化分析:完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;
4、专业化团队:资深的技术团队具有多年项目方案设计、实验操作、售后分析等经验;
5、全流程服务:提供组织抽核、单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。
伯豪生物丰富的单细胞核抽提经验
利用自主研发的“伯优细胞核分离试剂盒”已经完成大脑皮层、下丘脑、海马、延髓、松果体、肝脏、心脏、胶质瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多种组织的抽核制备及上机测序。
送样要求
1、组织用量:黄豆粒大小 1 块;
2、样本处理:组织液氮速冻,-80℃保存;
3、质量要求:组织 RNA 无降解,RIN≥7;
4、运输方式:干冰运输。
应用方向
冷冻样本;通过消化难拿到高质量的单细胞悬液的组织类型。
结果展示
1)脑组织
▲脑组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果
脑组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:神经元(Neurons)73.0%;星形胶质细胞(Astrocytes)9.4%;少突胶质细胞(Oligodendrocytes)9.2%;内皮细胞(Endothelial cells)6.7%;小胶质细胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘胶质细胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。
2)心脏组织
▲心脏组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果
心脏组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:心肌细胞(Cardiomyocytes)38.8%;内皮细胞(Endothelial cells)30.3%;成纤维细胞(Fibroblasts)16.6;神经元细胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬细胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;间皮细胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 细胞分别占 0.4%;中性粒细胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪细胞(Adipocytes)0.2% 及髓细胞(Myeloid cells)0.1%。
3)肝脏组织
▲肝脏组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果
肝脏组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:肝细胞(Hepatocytes)56.0%;内皮细胞(Endothelial cells)10.9%;胆管细胞(Cholangiocytes)9.4%;成纤维细胞(Fibroblasts)9.2%;星状细胞(Stellate cells)8.7%;T 细胞 4.7% 及 B 细胞 1.1%。
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